公司档案管理制度的建立主要目的是为了更好的管理公司内部档案及重要文件的管理和归纳，保证公司档案的完整性和正常的运行。公司档案是指公司在生产经营和管理活动中的具有保存价值的文件材料；公司应该明确管理档案的部门和员工，提高员工的档案管理意识，保证档案的整洁。
档案管理部门负责部分：
1. 负责公司整体档案的集中管理，及时检查档案的完整，监管其他部门的档案管理工作。
2. 建立合理的公司档案管理制度，给予指导、监督档案的执行情况。
3. 对公司的档案和其他资料进行收集、整理、分类、统计、保管的工作。
4. 提高各个部门之间档案信息的流动性，促进信息传递。
5. 负责工作变动时档案的移交工作。
除去档案管理部分所负责的部分，其他部门也要管理好本部门的文件资料的日常收集、标注、保管、归档的工作；需要向档案管理部门移交文件资料或合同文件。财务部门则需要独立建立保管财务档案资料。各部门在公司各项经营管理活动中所形成了各种有价值的文件材料都属于归档范围。
公司档案管理制度的建立需要公司采取有效措施对档案的安全性实施保障，加强保密工作，对于档案管理期限已满的，确保已无保管价值的的档案就进行登记，按照有关规定进行监销。公司应做好档案的统计工作，国有企业应该按照有关部门的要求填写相关的报表。
公司专职档案管理人员需要认真学习专业知识，认真遵守公司档案管理制度，熟悉本部门的文件整理、归档工作，工作认真负责，按时完成档案的归档，把好档案的质量关。严格执行各项档案管理制度。
